На том месте где предали земле мощи святого в IV веке была построена деревянная церковь в его честь, а затем в IX-Xвв. — каменный храм.

Храм Святого апостола Симона Кананита представляет собой крестово-купольную трехапсидную конструкцию. Апсида, расположенная в центре, пятигранная, две боковые — полукруглые. По своей композиции церковь относиться к раннесредневековой храмовой архитектуре  Абхазии.

Сухумские епископы держали здесь свою кафедру. Храм служил также в определенное время усыпальницей духовных особ абхазской церкви. Большой интерес представляют остатки фресок и надписей на древнегреческом языке, сделанные в IX-Xвв. Одна  из надписей, расположенная над южными вратами, в переводе читается так: «Матерь Божия! Спаси Георгия пречистого, митрополита». Сохранились также фрагменты каменной  резьбы в виде орнаментального  креста. Под  штукатуркой на северной стене проступает фреска с изображением святого  великомученика и целителя Пантелеимона. А у внутренней южной стены в 1889 году был захоронен епископ Сухумский Геннадий.

В XVII веке во время турецкого господства храм пришел в запустение и был частично разрушен. После того как в 1875 году Александр II передал  развалины храма монастырю, монахи немедленно приступили к реставрации. Восстановление было закончено в начале 1882 года, и тогда же обновленный храм, украшенный новым дубовым иконостасом, был освящен. При реставрации внешний облик храма практически не изменился.

Этот религиозно- архитектурный памятник посещали тысячи паломников из разных стран. Среди них французский путешественник Фредерик Дюбуа де Монперэ, любитель старины генерал А. Л. Муравьев. В 1884 году храм посетил архимандрит  Леонид (Кавелин).

В настоящее время храм является действующим, и его посещают тысячи паломников и простых туристов.